Esto es algo que a mi parecer se debio dar hace mucho tiempo, tanto Compiz asi como Beryl, apuntaban a lo mismo y eso al parecer generaba pequeñas discrepancias en los usuarios finales al querer utilizar cualquiera de los dos o los dos al mismo tiempo. Particularmente yo preferia utilizar Beryl por todo lo que mostro, pero ahora, podemos estar tranquilos dado que estos dos productos se han unido demostrando asi que se trabaja mejor en equipo y apuntando a un solo objetivo, bien por eso 
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Estube vagando por la web y me tope con este pequeño tutorial el cual te explica como configurar Compiz Fusion en tu Ubuntu Feisty.
